Walaupun Oncom memiliki banyak manfaat dan dapat menjadi sumber protein alternatif, tetap ada beberapa hal yang harus diperhatikan ketika memakannya.
Salah satu hal penting dalam mengonsumsi Oncom adalah memastikan kebersihan dalam proses pembuatannya.
Oncom yang sudah disimpan lama akan berkurang kandungan proteinnya karena terjadi degradasi oleh enzim proteolitik.
Proses degradasi ini akan mengakibatkan terbentuknya amonia dalam Oncom yang justru membuatnya tidak layak untuk dikonsumsi lagi.***